Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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