Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
SOBPA7XYQ1 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SOBPA7XYQ1 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
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