Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms