Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ALYREFQ86V81 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ALYREFQ86V81 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ALYREFQ86V81 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ALYREFQ86V81 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ALYREFQ86V81 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
ALYREFQ86V81 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ALYREFQ86V81 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
ALYREFQ86V81 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
ALYREFQ86V81 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
ALYREFQ86V81 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALYREFQ86V81 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALYREFQ86V81 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALYREFQ86V81 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALYREFQ86V81 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALYREFQ86V81 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALYREFQ86V81 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALYREFQ86V81 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALYREFQ86V81 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALYREFQ86V81 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALYREFQ86V81 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALYREFQ86V81 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALYREFQ86V81 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALYREFQ86V81 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALYREFQ86V81 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALYREFQ86V81 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALYREFQ86V81 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALYREFQ86V81 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALYREFQ86V81 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALYREFQ86V81 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALYREFQ86V81 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ALYREFQ86V81 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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