Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD1Q16676 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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