Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SF1Q15637 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SF1Q15637 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SF1Q15637 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SF1Q15637 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SF1Q15637 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SF1Q15637 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SF1Q15637 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SF1Q15637 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SF1Q15637 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SF1Q15637 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SF1Q15637 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SF1Q15637 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SF1Q15637 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SF1Q15637 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SF1Q15637 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SF1Q15637 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SF1Q15637 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SF1Q15637 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SF1Q15637 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SF1Q15637 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SF1Q15637 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SF1Q15637 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SF1Q15637 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SF1Q15637 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SF1Q15637 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SF1Q15637 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SF1Q15637 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SF1Q15637 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SF1Q15637 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SF1Q15637 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SF1Q15637 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SF1Q15637 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SF1Q15637 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SF1Q15637 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SF1Q15637 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SF1Q15637 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SF1Q15637 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SF1Q15637 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SF1Q15637 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SF1Q15637 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SF1Q15637 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SF1Q15637 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SF1Q15637 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SF1Q15637 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SF1Q15637 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SF1Q15637 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SF1Q15637 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SF1Q15637 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SF1Q15637 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SF1Q15637 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SF1Q15637 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SF1Q15637 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SF1Q15637 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SF1Q15637 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SF1Q15637 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SF1Q15637 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SF1Q15637 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SF1Q15637 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SF1Q15637 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SF1Q15637 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SF1Q15637 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SF1Q15637 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SF1Q15637 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SF1Q15637 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SF1Q15637 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SF1Q15637 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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SF1Q15637 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SF1Q15637 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SF1Q15637 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SF1Q15637 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SF1Q15637 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SF1Q15637 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SF1Q15637 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SF1Q15637 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SF1Q15637 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SF1Q15637 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SF1Q15637 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SF1Q15637 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SF1Q15637 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SF1Q15637 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SF1Q15637 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SF1Q15637 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SF1Q15637 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SF1Q15637 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SF1Q15637 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SF1Q15637 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SF1Q15637 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SF1Q15637 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SF1Q15637 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SF1Q15637 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SF1Q15637 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SF1Q15637 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SF1Q15637 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SF1Q15637 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SF1Q15637 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SF1Q15637 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SF1Q15637 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SF1Q15637 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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