Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MCCD1P59942 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
MCCD1P59942 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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