Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221 ms