Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
DDR2Q16832 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
DDR2Q16832 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDR2Q16832 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDR2Q16832 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDR2Q16832 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDR2Q16832 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDR2Q16832 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDR2Q16832 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDR2Q16832 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDR2Q16832 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDR2Q16832 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDR2Q16832 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDR2Q16832 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDR2Q16832 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDR2Q16832 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDR2Q16832 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
DDR2Q16832 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
DDR2Q16832 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
DDR2Q16832 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
DDR2Q16832 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
DDR2Q16832 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.4 ms