Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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GRIK5Q16478 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIK5Q16478 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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GRIK5Q16478 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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GRIK5Q16478 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK5Q16478 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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