Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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