Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms