Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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