Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
MKRN4PQ13434 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
MKRN4PQ13434 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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