Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTGDRQ13258 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTGDRQ13258 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTGDRQ13258 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTGDRQ13258 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTGDRQ13258 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTGDRQ13258 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTGDRQ13258 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTGDRQ13258 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTGDRQ13258 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTGDRQ13258 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTGDRQ13258 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTGDRQ13258 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTGDRQ13258 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTGDRQ13258 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTGDRQ13258 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTGDRQ13258 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTGDRQ13258 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTGDRQ13258 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTGDRQ13258 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTGDRQ13258 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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PTGDRQ13258 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
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PTGDRQ13258 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
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PTGDRQ13258 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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PTGDRQ13258 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTGDRQ13258 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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