Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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CHSY3Q70JA7 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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CHSY3Q70JA7 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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CHSY3Q70JA7 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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CHSY3Q70JA7 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHSY3Q70JA7 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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