Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD1Q16676 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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