Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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