Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
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MKRN4PQ13434 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
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MKRN4PQ13434 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
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MKRN4PQ13434 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
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MKRN4PQ13434 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
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MKRN4PQ13434 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
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MKRN4PQ13434 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
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MKRN4PQ13434 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
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MKRN4PQ13434 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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MKRN4PQ13434 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
MKRN4PQ13434 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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