Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NFIAQ12857 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NFIAQ12857 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NFIAQ12857 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
NFIAQ12857 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NFIAQ12857 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NFIAQ12857 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NFIAQ12857 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NFIAQ12857 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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NFIAQ12857 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NFIAQ12857 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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