Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRHP20396 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRHP20396 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRHP20396 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRHP20396 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRHP20396 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRHP20396 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRHP20396 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRHP20396 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRHP20396 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRHP20396 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRHP20396 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRHP20396 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRHP20396 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRHP20396 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRHP20396 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRHP20396 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRHP20396 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRHP20396 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRHP20396 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRHP20396 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRHP20396 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRHP20396 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRHP20396 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRHP20396 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRHP20396 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRHP20396 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRHP20396 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRHP20396 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRHP20396 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRHP20396 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRHP20396 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRHP20396 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRHP20396 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRHP20396 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRHP20396 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRHP20396 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRHP20396 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRHP20396 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRHP20396 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRHP20396 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRHP20396 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRHP20396 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRHP20396 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRHP20396 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRHP20396 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRHP20396 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRHP20396 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRHP20396 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRHP20396 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRHP20396 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRHP20396 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRHP20396 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRHP20396 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRHP20396 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRHP20396 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRHP20396 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRHP20396 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRHP20396 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRHP20396 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRHP20396 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRHP20396 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRHP20396 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRHP20396 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRHP20396 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRHP20396 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRHP20396 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRHP20396 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRHP20396 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRHP20396 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRHP20396 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRHP20396 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRHP20396 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRHP20396 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRHP20396 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRHP20396 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRHP20396 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRHP20396 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRHP20396 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRHP20396 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRHP20396 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRHP20396 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRHP20396 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRHP20396 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRHP20396 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRHP20396 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRHP20396 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRHP20396 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRHP20396 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRHP20396 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRHP20396 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRHP20396 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRHP20396 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRHP20396 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRHP20396 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRHP20396 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRHP20396 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRHP20396 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRHP20396 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRHP20396 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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