Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PGPEP1Q9NXJ5 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PGPEP1Q9NXJ5 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms