Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LTBP3Q9NS15 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LTBP3Q9NS15 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
LTBP3Q9NS15 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LTBP3Q9NS15 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LTBP3Q9NS15 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
LTBP3Q9NS15 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
LTBP3Q9NS15 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LTBP3Q9NS15 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LTBP3Q9NS15 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LTBP3Q9NS15 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LTBP3Q9NS15 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LTBP3Q9NS15 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LTBP3Q9NS15 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LTBP3Q9NS15 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LTBP3Q9NS15 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LTBP3Q9NS15 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LTBP3Q9NS15 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LTBP3Q9NS15 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LTBP3Q9NS15 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
LTBP3Q9NS15 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
LTBP3Q9NS15 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
LTBP3Q9NS15 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
LTBP3Q9NS15 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
LTBP3Q9NS15 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.59□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC2.59□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.59□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC2.59□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.59□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.59□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.59□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.59□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.59□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.59□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.54□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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