Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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