Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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PTPRNQ16849 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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PTPRNQ16849 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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PTPRNQ16849 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
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PTPRNQ16849 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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PTPRNQ16849 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRNQ16849 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
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PTPRNQ16849 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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PTPRNQ16849 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRNQ16849 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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