Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKN1Q16512 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKN1Q16512 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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