Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP1A4Q13733 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.1 ms