Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
MKRN4PQ13434 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
MKRN4PQ13434 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
MKRN4PQ13434 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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