Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
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