Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRNQ16849 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms