Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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