Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD1Q16676 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD1Q16676 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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