Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ANKRD35Q8N283 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD35Q8N283 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD35Q8N283 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD35Q8N283 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD35Q8N283 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD35Q8N283 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD35Q8N283 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD35Q8N283 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD35Q8N283 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD35Q8N283 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD35Q8N283 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD35Q8N283 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD35Q8N283 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD35Q8N283 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD35Q8N283 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD35Q8N283 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD35Q8N283 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANKRD35Q8N283 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANKRD35Q8N283 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANKRD35Q8N283 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms