Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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