Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141 ms