Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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