Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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PTGDRQ13258 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
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PTGDRQ13258 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTGDRQ13258 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
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PTGDRQ13258 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTGDRQ13258 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTGDRQ13258 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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PTGDRQ13258 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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PTGDRQ13258 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTGDRQ13258 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTGDRQ13258 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTGDRQ13258 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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PTGDRQ13258 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTGDRQ13258 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTGDRQ13258 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTGDRQ13258 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTGDRQ13258 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTGDRQ13258 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTGDRQ13258 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTGDRQ13258 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTGDRQ13258 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTGDRQ13258 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTGDRQ13258 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTGDRQ13258 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTGDRQ13258 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTGDRQ13258 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTGDRQ13258 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTGDRQ13258 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTGDRQ13258 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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