Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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TRAF1Q13077 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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TRAF1Q13077 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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TRAF1Q13077 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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TRAF1Q13077 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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TRAF1Q13077 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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TRAF1Q13077 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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TRAF1Q13077 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
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TRAF1Q13077 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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TRAF1Q13077 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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TRAF1Q13077 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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