Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CTIFO43310 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CTIFO43310 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CTIFO43310 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CTIFO43310 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CTIFO43310 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CTIFO43310 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CTIFO43310 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CTIFO43310 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CTIFO43310 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTIFO43310 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTIFO43310 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTIFO43310 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTIFO43310 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTIFO43310 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTIFO43310 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTIFO43310 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CTIFO43310 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTIFO43310 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CTIFO43310 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTIFO43310 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTIFO43310 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTIFO43310 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTIFO43310 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTIFO43310 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTIFO43310 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTIFO43310 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTIFO43310 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTIFO43310 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTIFO43310 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTIFO43310 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTIFO43310 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTIFO43310 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTIFO43310 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTIFO43310 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTIFO43310 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CTIFO43310 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTIFO43310 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTIFO43310 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTIFO43310 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTIFO43310 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTIFO43310 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTIFO43310 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTIFO43310 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTIFO43310 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CTIFO43310 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTIFO43310 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTIFO43310 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CTIFO43310 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CTIFO43310 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTIFO43310 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTIFO43310 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTIFO43310 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTIFO43310 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTIFO43310 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTIFO43310 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTIFO43310 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTIFO43310 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTIFO43310 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTIFO43310 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTIFO43310 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTIFO43310 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTIFO43310 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTIFO43310 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTIFO43310 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTIFO43310 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTIFO43310 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTIFO43310 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CTIFO43310 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTIFO43310 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTIFO43310 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTIFO43310 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTIFO43310 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTIFO43310 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTIFO43310 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTIFO43310 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTIFO43310 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTIFO43310 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTIFO43310 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTIFO43310 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTIFO43310 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTIFO43310 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTIFO43310 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTIFO43310 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTIFO43310 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTIFO43310 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTIFO43310 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTIFO43310 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTIFO43310 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTIFO43310 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTIFO43310 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTIFO43310 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTIFO43310 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTIFO43310 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTIFO43310 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTIFO43310 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CTIFO43310 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTIFO43310 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CTIFO43310 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTIFO43310 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.1 ms