Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms