Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.53□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
OTOP3Q7RTS5 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
OTOP3Q7RTS5 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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