Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ANKRD39Q53RE8 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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