Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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SEC23BQ15437 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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