Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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