Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3FQ13275 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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