Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RESTQ13127 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RESTQ13127 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RESTQ13127 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RESTQ13127 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RESTQ13127 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RESTQ13127 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RESTQ13127 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RESTQ13127 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RESTQ13127 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RESTQ13127 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RESTQ13127 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RESTQ13127 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RESTQ13127 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RESTQ13127 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RESTQ13127 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RESTQ13127 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RESTQ13127 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RESTQ13127 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RESTQ13127 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RESTQ13127 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RESTQ13127 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RESTQ13127 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RESTQ13127 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RESTQ13127 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RESTQ13127 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RESTQ13127 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RESTQ13127 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RESTQ13127 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RESTQ13127 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RESTQ13127 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RESTQ13127 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RESTQ13127 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RESTQ13127 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RESTQ13127 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RESTQ13127 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RESTQ13127 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RESTQ13127 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RESTQ13127 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RESTQ13127 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RESTQ13127 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RESTQ13127 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RESTQ13127 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RESTQ13127 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RESTQ13127 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RESTQ13127 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RESTQ13127 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RESTQ13127 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RESTQ13127 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RESTQ13127 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RESTQ13127 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RESTQ13127 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RESTQ13127 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RESTQ13127 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RESTQ13127 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RESTQ13127 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RESTQ13127 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
RESTQ13127 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RESTQ13127 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RESTQ13127 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RESTQ13127 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RESTQ13127 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RESTQ13127 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RESTQ13127 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RESTQ13127 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RESTQ13127 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RESTQ13127 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
RESTQ13127 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
RESTQ13127 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RESTQ13127 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RESTQ13127 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RESTQ13127 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RESTQ13127 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RESTQ13127 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RESTQ13127 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RESTQ13127 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RESTQ13127 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RESTQ13127 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RESTQ13127 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RESTQ13127 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RESTQ13127 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RESTQ13127 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RESTQ13127 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RESTQ13127 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RESTQ13127 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RESTQ13127 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RESTQ13127 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RESTQ13127 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RESTQ13127 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RESTQ13127 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RESTQ13127 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RESTQ13127 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RESTQ13127 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RESTQ13127 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RESTQ13127 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RESTQ13127 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RESTQ13127 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RESTQ13127 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RESTQ13127 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RESTQ13127 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.1 ms