Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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