Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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