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| FOXD4L3 | Q6VB84 | Y_RNA.659-201 | ENST00000515994 | 113 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | SUMO2P16-201 | ENST00000519475 | 264 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
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| FOXD4L3 | Q6VB84 | MCF2-204 | ENST00000414978 | 3813 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | FILIP1L-206 | ENST00000471562 | 2854 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | ARHGAP11A-207 | ENST00000565905 | 3318 nt | TSL 2 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | OR4K2-204 | ENST00000641885 | 8681 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | SNORD116-10-201 | ENST00000363791 | 102 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | Y_RNA.360-201 | ENST00000365512 | 102 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | SNORA9-201 | ENST00000384215 | 133 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | UBE2Q2P12-201 | ENST00000414573 | 204 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
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| FOXD4L3 | Q6VB84 | RNU6-539P-201 | ENST00000516665 | 103 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | MIR548Z-201 | ENST00000584743 | 97 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | MIR4765-201 | ENST00000585007 | 77 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | U6.73-201 | ENST00000619194 | 103 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | RNY1P4-201 | ENST00000384595 | 115 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | RNVU1-14-201 | ENST00000384770 | 164 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | TRAV41-201 | ENST00000390468 | 336 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | RNU6-733P-201 | ENST00000410759 | 104 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | SUMO1P4-201 | ENST00000429430 | 302 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | AC125388.1-201 | ENST00000459631 | 156 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | SCARNA17.1-201 | ENST00000516211 | 143 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | SCARNA17.2-201 | ENST00000516334 | 143 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | RNU2-34P-201 | ENST00000516534 | 121 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | RNU6-1270P-201 | ENST00000517128 | 108 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | JPX_2.1-201 | ENST00000614161 | 69 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | SCARNA17.4-201 | ENST00000614296 | 143 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | MIR6733-201 | ENST00000635723 | 61 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | CLUL1-208 | ENST00000581619 | 2449 nt | TSL 2 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | SYCP2-201 | ENST00000357552 | 5567 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | PCDH11Y-201 | ENST00000215473 | 4595 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |