Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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